Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV1

Pam16, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM16, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pam16Q9CQV1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pam16Q9CQV1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pam16Q9CQV1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms