Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rer1Q9CQU3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rer1Q9CQU3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms