Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PompQ9CQT5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PompQ9CQT5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PompQ9CQT5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms