Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9CQ90 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CQ90 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CQ90 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CQ90 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9CQ90 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9CQ90 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9CQ90 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQ90 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQ90 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQ90 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQ90 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQ90 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CQ90 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CQ90 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQ90 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQ90 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQ90 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQ90 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQ90 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQ90 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms