Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI4

Lpin3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpin3Q99PI4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lpin3Q99PI4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lpin3Q99PI4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lpin3Q99PI4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lpin3Q99PI4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lpin3Q99PI4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lpin3Q99PI4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lpin3Q99PI4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lpin3Q99PI4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lpin3Q99PI4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lpin3Q99PI4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lpin3Q99PI4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lpin3Q99PI4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lpin3Q99PI4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lpin3Q99PI4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lpin3Q99PI4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lpin3Q99PI4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms