Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GpnmbQ99P91 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GpnmbQ99P91 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GpnmbQ99P91 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GpnmbQ99P91 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms