Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rad54l2Q99NG0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rad54l2Q99NG0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rad54l2Q99NG0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rad54l2Q99NG0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rad54l2Q99NG0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rad54l2Q99NG0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rad54l2Q99NG0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Rad54l2Q99NG0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rad54l2Q99NG0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rad54l2Q99NG0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rad54l2Q99NG0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rad54l2Q99NG0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rad54l2Q99NG0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rad54l2Q99NG0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rad54l2Q99NG0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rad54l2Q99NG0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rad54l2Q99NG0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rad54l2Q99NG0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rad54l2Q99NG0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Rad54l2Q99NG0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rad54l2Q99NG0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rad54l2Q99NG0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rad54l2Q99NG0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rad54l2Q99NG0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rad54l2Q99NG0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Rad54l2Q99NG0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Rad54l2Q99NG0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Rad54l2Q99NG0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rad54l2Q99NG0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rad54l2Q99NG0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rad54l2Q99NG0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Rad54l2Q99NG0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rad54l2Q99NG0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rad54l2Q99NG0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rad54l2Q99NG0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rad54l2Q99NG0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rad54l2Q99NG0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rad54l2Q99NG0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Rad54l2Q99NG0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rad54l2Q99NG0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rad54l2Q99NG0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rad54l2Q99NG0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rad54l2Q99NG0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rad54l2Q99NG0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rad54l2Q99NG0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rad54l2Q99NG0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rad54l2Q99NG0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rad54l2Q99NG0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rad54l2Q99NG0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rad54l2Q99NG0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rad54l2Q99NG0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rad54l2Q99NG0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rad54l2Q99NG0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Rad54l2Q99NG0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Rad54l2Q99NG0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Rad54l2Q99NG0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Rad54l2Q99NG0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms