Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cstf3Q99LI7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cstf3Q99LI7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cstf3Q99LI7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cstf3Q99LI7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cstf3Q99LI7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cstf3Q99LI7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cstf3Q99LI7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cstf3Q99LI7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cstf3Q99LI7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cstf3Q99LI7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cstf3Q99LI7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cstf3Q99LI7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cstf3Q99LI7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.8 ms