Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psmd6Q99JI4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psmd6Q99JI4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psmd6Q99JI4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psmd6Q99JI4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms