Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Derl1Q99J56 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Derl1Q99J56 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Derl1Q99J56 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms