Protein–RNA interactions for Protein: Q925E0

Sntg2, Gamma-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg2Q925E0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sntg2Q925E0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sntg2Q925E0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sntg2Q925E0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sntg2Q925E0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sntg2Q925E0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sntg2Q925E0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sntg2Q925E0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sntg2Q925E0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sntg2Q925E0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sntg2Q925E0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms