Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp4Q921I6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sh3bp4Q921I6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp4Q921I6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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