Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smc1bQ920F6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smc1bQ920F6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smc1bQ920F6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Smc1bQ920F6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms