Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cul7Q8VE73 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Cul7Q8VE73 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cul7Q8VE73 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cul7Q8VE73 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cul7Q8VE73 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cul7Q8VE73 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cul7Q8VE73 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cul7Q8VE73 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cul7Q8VE73 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Cul7Q8VE73 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cul7Q8VE73 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cul7Q8VE73 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cul7Q8VE73 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cul7Q8VE73 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cul7Q8VE73 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cul7Q8VE73 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cul7Q8VE73 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cul7Q8VE73 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cul7Q8VE73 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cul7Q8VE73 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cul7Q8VE73 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cul7Q8VE73 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cul7Q8VE73 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cul7Q8VE73 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Cul7Q8VE73 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cul7Q8VE73 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cul7Q8VE73 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cul7Q8VE73 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cul7Q8VE73 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cul7Q8VE73 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cul7Q8VE73 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cul7Q8VE73 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cul7Q8VE73 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cul7Q8VE73 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cul7Q8VE73 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cul7Q8VE73 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cul7Q8VE73 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cul7Q8VE73 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cul7Q8VE73 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cul7Q8VE73 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cul7Q8VE73 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cul7Q8VE73 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Cul7Q8VE73 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cul7Q8VE73 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cul7Q8VE73 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cul7Q8VE73 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Cul7Q8VE73 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cul7Q8VE73 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cul7Q8VE73 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cul7Q8VE73 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cul7Q8VE73 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cul7Q8VE73 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cul7Q8VE73 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cul7Q8VE73 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cul7Q8VE73 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cul7Q8VE73 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cul7Q8VE73 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cul7Q8VE73 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cul7Q8VE73 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Cul7Q8VE73 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Cul7Q8VE73 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Cul7Q8VE73 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cul7Q8VE73 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cul7Q8VE73 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cul7Q8VE73 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cul7Q8VE73 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cul7Q8VE73 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cul7Q8VE73 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cul7Q8VE73 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cul7Q8VE73 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cul7Q8VE73 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cul7Q8VE73 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cul7Q8VE73 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cul7Q8VE73 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cul7Q8VE73 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cul7Q8VE73 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cul7Q8VE73 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Cul7Q8VE73 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cul7Q8VE73 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cul7Q8VE73 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cul7Q8VE73 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cul7Q8VE73 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Cul7Q8VE73 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Cul7Q8VE73 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cul7Q8VE73 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cul7Q8VE73 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cul7Q8VE73 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cul7Q8VE73 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cul7Q8VE73 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cul7Q8VE73 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cul7Q8VE73 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cul7Q8VE73 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cul7Q8VE73 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cul7Q8VE73 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 226.3 ms