Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4B8

Nlrp3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp3Q8R4B8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nlrp3Q8R4B8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nlrp3Q8R4B8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nlrp3Q8R4B8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlrp3Q8R4B8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms