Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim29Q8R2Q0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim29Q8R2Q0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim29Q8R2Q0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim29Q8R2Q0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim29Q8R2Q0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms