Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r200Q8R281 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r200Q8R281 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms