Protein–RNA interactions for Protein: Q8K348

Acvr1c, Activin receptor type-1C, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1cQ8K348 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Acvr1cQ8K348 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Acvr1cQ8K348 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Acvr1cQ8K348 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Acvr1cQ8K348 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms