Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Otud6bQ8K2H2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Otud6bQ8K2H2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Otud6bQ8K2H2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Otud6bQ8K2H2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Otud6bQ8K2H2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Otud6bQ8K2H2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Otud6bQ8K2H2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Otud6bQ8K2H2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Otud6bQ8K2H2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Otud6bQ8K2H2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Otud6bQ8K2H2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Otud6bQ8K2H2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otud6bQ8K2H2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Otud6bQ8K2H2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud6bQ8K2H2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud6bQ8K2H2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud6bQ8K2H2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Otud6bQ8K2H2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Otud6bQ8K2H2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms