Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abcf3Q8K268 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcf3Q8K268 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Abcf3Q8K268 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcf3Q8K268 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms