Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stx5Q8K1E0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Stx5Q8K1E0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx5Q8K1E0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Stx5Q8K1E0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stx5Q8K1E0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx5Q8K1E0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx5Q8K1E0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx5Q8K1E0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Stx5Q8K1E0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
Stx5Q8K1E0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx5Q8K1E0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx5Q8K1E0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx5Q8K1E0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx5Q8K1E0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Stx5Q8K1E0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx5Q8K1E0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx5Q8K1E0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stx5Q8K1E0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Stx5Q8K1E0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Stx5Q8K1E0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx5Q8K1E0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx5Q8K1E0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms