Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CopaQ8CIE6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CopaQ8CIE6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms