Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Rp1l1Q8CGM2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rp1l1Q8CGM2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rp1l1Q8CGM2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rp1l1Q8CGM2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rp1l1Q8CGM2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rp1l1Q8CGM2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rp1l1Q8CGM2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rp1l1Q8CGM2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rp1l1Q8CGM2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rp1l1Q8CGM2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rp1l1Q8CGM2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rp1l1Q8CGM2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rp1l1Q8CGM2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rp1l1Q8CGM2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rp1l1Q8CGM2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rp1l1Q8CGM2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rp1l1Q8CGM2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms