Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ephb1Q8CBF3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ephb1Q8CBF3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ephb1Q8CBF3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ephb1Q8CBF3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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