Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp20Q8C6M1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp20Q8C6M1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp20Q8C6M1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms