Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apol7cQ8C6E1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apol7cQ8C6E1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol7cQ8C6E1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms