Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp37Q8C0R0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp37Q8C0R0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp37Q8C0R0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms