Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trub1Q8C0D0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trub1Q8C0D0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trub1Q8C0D0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub1Q8C0D0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub1Q8C0D0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub1Q8C0D0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub1Q8C0D0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub1Q8C0D0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub1Q8C0D0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub1Q8C0D0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub1Q8C0D0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub1Q8C0D0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub1Q8C0D0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub1Q8C0D0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trub1Q8C0D0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trub1Q8C0D0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trub1Q8C0D0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trub1Q8C0D0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trub1Q8C0D0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms