Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdcl3Q8BVF2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdcl3Q8BVF2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdcl3Q8BVF2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pdcl3Q8BVF2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdcl3Q8BVF2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 385.8 ms