Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bicd1Q8BR07 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bicd1Q8BR07 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bicd1Q8BR07 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bicd1Q8BR07 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Bicd1Q8BR07 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bicd1Q8BR07 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bicd1Q8BR07 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms