Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gpc2Q8BKV1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpc2Q8BKV1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gpc2Q8BKV1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpc2Q8BKV1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpc2Q8BKV1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpc2Q8BKV1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpc2Q8BKV1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpc2Q8BKV1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc2Q8BKV1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc2Q8BKV1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc2Q8BKV1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc2Q8BKV1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpc2Q8BKV1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpc2Q8BKV1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpc2Q8BKV1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpc2Q8BKV1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpc2Q8BKV1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpc2Q8BKV1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpc2Q8BKV1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gpc2Q8BKV1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpc2Q8BKV1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms