Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Htatsf1Q8BGC0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Htatsf1Q8BGC0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Htatsf1Q8BGC0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms