Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsg1bQ7TSF1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsg1bQ7TSF1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsg1bQ7TSF1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dsg1bQ7TSF1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dsg1bQ7TSF1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms