Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clec4b1Q7TS58 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clec4b1Q7TS58 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clec4b1Q7TS58 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec4b1Q7TS58 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clec4b1Q7TS58 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms