Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM9

Tubb2a, Tubulin beta-2A chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2aQ7TMM9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubb2aQ7TMM9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubb2aQ7TMM9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubb2aQ7TMM9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubb2aQ7TMM9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubb2aQ7TMM9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubb2aQ7TMM9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubb2aQ7TMM9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubb2aQ7TMM9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb2aQ7TMM9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb2aQ7TMM9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tubb2aQ7TMM9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubb2aQ7TMM9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubb2aQ7TMM9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tubb2aQ7TMM9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubb2aQ7TMM9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms