Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smg5Q6ZPY2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Smg5Q6ZPY2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg5Q6ZPY2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg5Q6ZPY2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms