Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY53

AY358078, HN1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY358078Q6UY53 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AY358078Q6UY53 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AY358078Q6UY53 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AY358078Q6UY53 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms