Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc85bQ6PDY0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc85bQ6PDY0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc85bQ6PDY0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms