Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sarm1Q6PDS3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sarm1Q6PDS3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sarm1Q6PDS3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms