Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atl2Q6PA06 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atl2Q6PA06 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl2Q6PA06 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms