Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Szrd1Q6NXN1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Szrd1Q6NXN1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms