Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KdsrQ6GV12 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KdsrQ6GV12 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KdsrQ6GV12 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KdsrQ6GV12 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms