Protein–RNA interactions for Protein: Q63959

Kcnc3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc3Q63959 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20,59■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20,58■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20,58■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,58■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20,55■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20,55■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20,54■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,52■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20,52■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20,52■□□□□ 0,88
Kcnc3Q63959 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20,51■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20,51■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,49■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,49■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,48■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,48■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20,46■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20,46■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Kcnc3Q63959 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20,44■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20,44■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20,43■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Kcnc3Q63959 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49,1 ms