Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps72Q62481 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps72Q62481 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps72Q62481 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps72Q62481 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms