Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vil1Q62468 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vil1Q62468 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vil1Q62468 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vil1Q62468 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vil1Q62468 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Vil1Q62468 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vil1Q62468 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vil1Q62468 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vil1Q62468 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Vil1Q62468 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vil1Q62468 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vil1Q62468 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vil1Q62468 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vil1Q62468 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vil1Q62468 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vil1Q62468 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vil1Q62468 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vil1Q62468 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vil1Q62468 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vil1Q62468 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vil1Q62468 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Vil1Q62468 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vil1Q62468 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vil1Q62468 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vil1Q62468 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vil1Q62468 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms