Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema3cQ62181 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3cQ62181 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3cQ62181 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms