Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sema3bQ62177 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sema3bQ62177 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sema3bQ62177 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sema3bQ62177 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sema3bQ62177 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sema3bQ62177 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema3bQ62177 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema3bQ62177 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema3bQ62177 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema3bQ62177 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sema3bQ62177 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms