Protein–RNA interactions for Protein: Q62172

Ralbp1, RalA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ralbp1Q62172 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ralbp1Q62172 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ralbp1Q62172 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ralbp1Q62172 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ralbp1Q62172 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ralbp1Q62172 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ralbp1Q62172 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ralbp1Q62172 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ralbp1Q62172 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ralbp1Q62172 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ralbp1Q62172 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ralbp1Q62172 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ralbp1Q62172 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ralbp1Q62172 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ralbp1Q62172 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ralbp1Q62172 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ralbp1Q62172 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ralbp1Q62172 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ralbp1Q62172 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ralbp1Q62172 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ralbp1Q62172 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ralbp1Q62172 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ralbp1Q62172 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ralbp1Q62172 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ralbp1Q62172 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ralbp1Q62172 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ralbp1Q62172 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ralbp1Q62172 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ralbp1Q62172 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ralbp1Q62172 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ralbp1Q62172 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ralbp1Q62172 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ralbp1Q62172 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ralbp1Q62172 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ralbp1Q62172 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms