Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim27Q62158 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Trim27Q62158 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim27Q62158 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim27Q62158 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms