Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrn1Q61809 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrn1Q61809 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrn1Q61809 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrn1Q61809 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrn1Q61809 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrn1Q61809 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrn1Q61809 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrn1Q61809 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrn1Q61809 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrn1Q61809 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrn1Q61809 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrn1Q61809 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrn1Q61809 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrn1Q61809 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrn1Q61809 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrrn1Q61809 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrn1Q61809 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrn1Q61809 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms